通過與政府深化合作，以“信息統一與共享、業務管理統一與共享、資源管理統一與共享”為靶向，以“管理輸出+技術輸出”為載體，去領辦當地區域龍頭醫療機構，由當地龍頭醫療機構向下輻射區域內的醫療衛生機構，從而構筑起跨區域、覆蓋全域的“華西醫院-地市級醫院-縣級醫院-基層醫療機構”分級協同醫療服務體系。

為充分發揮華西醫院作為國家級疑難重癥醫療中心、國家臨床醫學研究中心及醫療協同網絡平臺的作用，輻射和帶動區域內、區域間醫療服務能力提升和醫療服務同質化，2016年起，華西醫院以優質學科資源為支撐，學科協作為紐帶，在已有醫療集團型醫聯體、領辦型醫聯體、遠程醫療協作網、城市社區聯盟的基礎上逐步探索學科聯盟醫聯體模式，組建以西部地區為主、輻射全國的特色專科醫聯體。
截至目前，四川大學華西醫院已牽頭成立23個學科聯盟，學科覆蓋心臟內科、腦卒中、急診、精神衛生、疼痛、耳鼻咽喉頭頸外科、康復、泌尿、血液、營養、皮膚、感染與肝病、消化內科、乳腺、骨科、呼吸與危重癥、視光、重癥醫學、腎科、消化外科、神經精神影像。來自全國27個省、直轄市、自治區共計577家兄弟醫院1300余個兄弟科室加入其中。華西學科聯盟旨在進一步加強聯盟單位學科內涵建設，在聯盟內推廣專科診療規范，推進疾病分級診療，建立專科醫療團隊同質化培養體系，加強科研合作，促進西部地區學科整體能力提升。