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          2020年四川大學華西醫院生物醫學大數據中心俞鵬課題組 博士后招聘啟事 2020.09.14

          四川大學華西醫院生物醫學大數據中心俞鵬課題組擬招收博士后數名。主要從事:1)生物信息學及實驗驗證,2)生物醫學信息學,3)生物醫學文獻審編和本體構建,4)藥用植物基因組學及合成生物學,5)化學信息學。課題組經費充足。

          一、 導師簡介

          俞鵬,四川大學華西醫院生物醫學大數據中心特聘研究員,國家級青年人才項目獲得者。博士畢業于美國德州大學奧斯汀分校,先后在貝勒醫學院、德州農機大學開展生物醫學信息學的研究,主要包括轉錄組學、選擇性剪接、高通量生物數據分析、數據審編、文本挖掘和本體構建等方面。在本領域權威期刊如Proc Natl Acad Sci USA、Bioinformatics 、Nucleic Acids Res 等上發表論文四十余篇,單篇最高Google學術引用307次,論文Google學術總引用1700余次。曾多次受邀于國內外高校、會議等做研究報告。其研究獲得了多家機構的支持,多次擔任CCF推薦B類會議ISMB和BIBM的技術程序委員會委員, 曾參與NIH 基金評審,還擔任學術期刊Scientific Reports 、PLoS ONE、BMC生物信息學副主編,并多次為學術期刊審稿。招聘詳情情況如下:

          二、博士后崗位基本要求

          1、具有國內外大學或研究機構的生物信息學、醫學信息學、計算機科學、統計學、生物化學、分子生物學、遺傳學、細胞生物學、微生物學、植物學、病理學和藥學等相關學科博士學位。

          2、能獨立和/或協助課題組負責人開展相關科研工作,有良好的團隊協作精神。

          3、良好的中、英文閱讀、寫作、翻譯及表達能力;認真負責,具團隊精神;能協助指導研究生科研工作。

          4、在相關領域發表過具影響力的、SCI收錄的專業期刊的第一作者或通訊作者論文。

          三、具體方向和要求

          1) 生物信息學及實驗驗證。針對能量代謝疾病,如肥胖癥等疾病及冷刺激誘導代謝過程,運用基因組、轉錄組、表征遺傳組、單細胞測序及宏基因組等大數據,綜合分子、細胞、遺傳等生物學實驗方法,研究基因調控過程和發病機理。應聘者滿足a或b任意一項即可。

          a. 計算:

          i. 具有生物信息學或計算機類相關專業博士學歷,有長期的測序數據分析經驗;

          ii. 熟悉各種常用的各種生物學和醫學數據庫;

          iii. 熟練掌握Python、Bash和R或其他生物信息學中常用的程序語言,Linux系統操作;

          iv. 熟悉常用的生物信息分析軟件,具備解釋信息分析的能力;

          v. 有測序數據分析、大數據分析經驗,良好的統計學背景者優先。

          b. 實驗:

          i. 具有分子生物學、細胞生物學、遺傳學、病理學及微生物學等相關專業的研究背景,有代謝研究經驗者優先;

          ii. 熟練掌握分子生物學、細胞生物學、遺傳學、免疫學、動物實驗及微生物學等相關實驗技術;

          iii. 熟練測序原理、掌握測序前樣本處理,包括但不限于脂肪細胞scRNA-Seq測序、PRO-Seq測序、ATAC-Seq測序、宏基因組測序以及ChIP-Seq測序,并可以及時發現測序樣本處理過程中的問題;

          ⅳ. 熟悉表觀遺傳、基因轉錄后修飾、細胞分化等相關知識者優先。

          2) 生物醫學信息學

          a. 具有知識庫、數據庫和網站建設、知識圖譜、自然語言處理、醫學圖像處理等方面經驗;

          b. 有機器學習或深度學習背景優先;有醫學或生物學背景優先。

          3) 生物醫學文獻審編及本體構建。

          a. 具有熟練和準確的英文文獻閱讀能力;

          b. 對于生物的各領域有較宏觀的把握,有代謝、和藥學和細胞動物模型等方面知識者優先;

          c. 無需做實驗,無需計算背景。能夠與計算背景的研究人員有效溝通。

          4)藥用植物基因組學及合成生物學。運用植物基因組學和轉錄組學等方法研究植物有效成分的合成途徑。 應聘者滿足a或b任意一項即可。

          a. 植物基因組學:

          i. 具有生物信息學,進化基因組學,數量遺傳學等領域的博士學位;

          ii. 熟悉二代與三代測序數據分析

          iii. 可以熟練使用Linux操作系統的相關命令,編寫Bash腳本。具有良好的計算機編程能力,掌握至少一種高級編程語言(包括Python)。具有良好的邏輯思維能力

          b. 合成生物學:

          i. 具有植物學相關專業博士學位;

          ii. 負責煙草等模式和藥用植物的培育,開展植物組織培養、轉基因植株構建;

          iii. 運用合成生物學的手段合成優質的植物天然產物;

          iv. 具有植物組織培養、轉基因植株構建經驗,熟悉煙草等模式植物培育者優先;

          v. 具有植物合成生物學知識者優先。

          5) 化學信息學。構建藥用植物數據庫,利用網絡藥理學、藥物協同作用等現代研究方法,發現中草藥中治療疾病的有效成分以及作用機理。開發新的機器學習與人工智能計算方法加快這一過程的實驗驗證。

          a. 具有化學、化學信息學、藥學、生物信息學及計算機科學等領域的博士學位;

          b. 掌握科學計算編程及腳本語言( Python/R/Bash script),以及數據庫及網站建設,熟練使用Linux操作系統;

          c. 熟悉常用機器學習算法并有實際工程經驗,對常用深度學習框架有一定了解;

          d. 掌握常用的化學信息學軟件或網站(RDkit、 CDK、NCBI、ChEMBL、BindDB等 );

          e. 有化學信息學和植物生物信息學研究背景者優先。

          四、待遇

          在站期間待遇、科研業績要求、以及出站后留院要求按四川大學華西醫院博士后管理相關規定執行,特別優秀者按項目需要提供國內外知名研究機構進行學習交流的機會。

          五、應聘方法

          應聘者請將詳細的個人簡歷(含學習工作經歷,論文成果清單和聯系方式),工作總結以及三個推薦人(含博士導師)的聯系方式同時電郵至蘇老師郵箱(郵件標題注明“生物醫學大數據中心博士后”)。

          聯系人:蘇老師(suzehao@wchscu.cn),電話:15882226303。


                                                        華西生物醫學大數據中心



          作者:人力資源部 來源:人力資源部
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